Ett 20-tal kommuner i Málagaprovinsen saknar fortfarande reningsverk. Till den listan ska läggas ytterligare åtta kommuner där reningsverk håller på att byggas, men ännu inte har tagits i bruk, eller där de inte fungerar på grund av bristande underhåll. De här kommunerna bryter därmed mot ett EU-direktiv som säger att alla orter med mer än 2 000 invånare ska ha installationer för att ta hand om avlopps- och smutsvatten. De allra flesta kommunerna ligger i provinsens inre delar. Det allvarligaste fallet är dock Nerja, som trots att man har 16 000 registrerade invånare på orten fortfarande saknar reningsverk. Det är än mer anmärkningsvärt då provinsens viktigaste marina naturområde ligger inom kommunen: Maro-Cerro Gordo.
