Pedro Sánchez är beroende av stöd från den katalanska självständighetsrörelsen Junts för att få igenom budget och fortsätta som regeringschef under den nuvarande mandatperioden.
På tisdagen togs beslut om den mycket kontroversiella reformen av immigrationslagen, där regeringen och Junts fastställde kriterierna för fördelningen av ensamkommande barn.
Katalonien behöver endast ta emot 20 eller 30 medan Madridregionen får ta emot 700.
Totalt handlar det om 4.400 barn och ungdomar, vissa uppgifter säger nära 6.000, utan medföljande förälder eller annan vårdnadshavare, så kallade ensamkommande barn, som har befunnit sig på Kanarieöarna i flera månader i väntan på att överflyttas till spanska fastlandet.
Hela debatten som riskerar att stigmatiseras och bidra till extremism handlar om hur många ensamkommande som ska placeras i de olika regionerna. Den separatistiska katalanska koalitionen Junts menar att Katalonien redan har tagit emot tillräckligt.
Katalonien kommer bara att ta emot mellan tjugo och trettio ensamkommande minderåriga jämfört med de 700 som kan hamna i Madrid, men som i verkligen beräknas bli 806.
796 placeras i Andalusien medan Baskien får 88 ensamkommande barn. Valenciaregionen får ta emot 477 medan Balearerna ska ta emot 58 enligt avtalet.
Det är befolkningsstorlek och tidigare insatser som gjorts som ligger till grund för hur många ensamkommande regionerna ska ta emot.
Junts talesperson i kongressen, Míriam Nogueras, säger att avtalet korrigerar en historisk ojämlikhet. Medan Katalonien alltid har bidraget med hjälp och gjort en stor insats har andra tittat åt andra hållet.
Samtidigt då som regeringschefen Sánchez är i akut behov av att få stöd från Katalonien.
Centralregeringen har gett regionerna tid fram till 31 mars att uppdatera och komma med siffror över hur många ensamkommande de tagit emot fram till nu för att göra mer exakta beräkningar vad gäller både fördelningen och finansiering.
Spanien ska enligt uppgifter ha 23.600 platser för barn i behov av skydd men i verkligheten är den siffran 19.000.
Regionpresidenten i Madrid, Isabel Díaz Ayuso, har meddelat att de tar avtalet mellan centralregeringen och Junts till domstol för prövning.
